El CEFIRE d’Innovació Educativa forma part de la xarxa de la Subdirecció General de Formació del Professorat i es gestiona des de la Direcció General d’Innovació i Inclusió Educativa a través de la Subdirecció General d’Innovació i Qualitat Educativa. Les dues Subdireccions Generals treballen i es coordinen per a promoure els plans, programes i accions d'innovació i qualitat educativa. 

El CEFIRE naix amb vocació de proximitat a través de la nova figura representada per les Assessories Territorials d’Innovació (ATI). Així, s’estructura i organitza al llarg de tota la Comunitat Valenciana, tenint la seu principal a la ciutat d’Alzira i, a més, presència en altres 7 seus: Castelló de la Plana, Sagunt, València, Elx, La Nucia, Alacant i Oriola. 

Amb l’objectiu principal d’impulsar la innovació, la funció dels ATI és acompanyar i assessorar de manera personalitzada els docents i els centres educatius en la participació dels projectes impulsats des de la Direcció General d’Innovació i Inclusió Educativa, detectant necessitats en matèria d’innovació i fomentant la creació de xarxes d’innovació educativa mitjançant l’organització de jornades d’innovació, seminaris, esdeveniments i trobades, fomentant la col·laboració amb altres entitats, organismes i altres agents de l’entorn. 

Entenem i emmarquem la innovació educativa com a eix vertebrador del procés d’aprenentatge així com de la millora i reconeixement professional docent; que convide a la reflexió, l’estudi, l’anàlisi, la pràctica i l’avaluació; a generar, compartir i difondre; a impulsar la transferibilitat i la sostenibilitat de totes aquelles pràctiques i experiències innovadores entre la comunitat educativa i, en definitiva, a que genere l’impacte desitjable en les nostres aules i alumnat.