El colegio fue inaugurado en 1931, con el nombre de Colegio Miguel de Unamuno. Después de varias reformas fue derruido y reconstruído a su estado actual. Después de la Guerra Civil se le cambió el nombre al actual: Cardenal Cisneros. El siguiente vídeo corresponde a la ceremonia de inauguración, y ha sido cedido por Miguel Angel Arquimbau, con la colaboración de la revista Parlem: